Nhiều doanh nghiệp sản xuất phân bón trong nước cho rằng, việc đưa mặt hàng phân bón vào danh mục không chịu thuế giá trị gia tăng (GTGT) không những không kéo giá phân bón giảm, ngược lại còn gây nên một số tác động tiêu cực, doanh nghiệp chịu thiệt hại kép, nông dân cũng không được hưởng lợi.